Yeryüzünde en çok bulunan organizmanın bakteriyofajlar olduğu düşünülmektedir. Öyle ki bakterilerin olduğu su kaynaklarında, deniz suyunda, tatlı su birikintilerinde, toprakta, bitkilerde, hayvanlar ve insanlarda bağırsak, akciğer, ağız ve cilt mikrobiyotası gibi birçok noktada bulunur.

Fajlar, bakterilere özgüdür ve yalnızca bakteriler içinde çoğalırlar. Dolayısıyla insan hücreleri için tamamen zararsızdır. Bu seçilim sayesinde sağlıklı insan hücrelerine zarar vermeyen bakteriyofajlar, insanlarda bakteriyel enfeksiyonlara karşı antibakteriyel tedavi potansiyeline sahiptir.